664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

EN RU

Статья учёных НЦ ПЗСРЧ опубликована в высокорейтинговом журнале «PLoS Neglected Tropical Diseases» (Q1)

25.05.2023
Научная работа учёных ФГБНУ НЦ ПЗСРЧ «The Baikal subtype of tick-borne encephalitis virus is evident of recombination between Siberian and Far-Eastern subtypes» опубликована в престижном научном журнале «PLoS Neglected Tropical Diseases». Статья подготовлена при участии сотрудников лаборатории молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики НЦ ПЗСРЧ: руководителя лаборатории, д.м.н. Ирины Валерьевны Козловой, младшего научного сотрудника Оксаны Васильевны Лисак,  лаборанта-исследователя Алексея Игоревича Парамонова.

В авторский коллектив статьи вошли биоинфоматики из  Сколковского института науки и технологий, лаборатории молекулярной эволюции «Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича» ОНИТ РАН,  Национального исследовательского университета «Высшая школа экономики», молекулярные биологи из отдела молекулярной диагностики ФБУН «Центральный НИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора».

Статья посвящена исследованию по поиску рекомбинаций в геномах вируса клещевого энцефалита, выполненному на примере штаммов Байкальского субтипа из коллекции ФГБНУ НЦ ПЗСРЧ.

PLoS Neglected Tropical Diseases – Международный междисциплинарный рецензируемый научный журнал с открытым доступом для публикаций, который публикует научные исследования и обзоры в сфере естественных и медицинских наук. Журнал индексируется в крупных международных базах данных Scopus, SCIE (Web of Science), PubMed и др.

Рейтинг журнала: JCR – Q1  (Infectious Diseases)

Импакт-фактор: 1,3 (2022 г.).

Как пояснила Ирина Валерьевна Козлова, байкальский субтип вируса клещевого энцефалита циркулирует на территории Восточной Сибири и Монголии, где одновременно встречаются сразу несколько субтипов вируса, что предполагает наличие потенциальной возможности обмена генетической информацией между ними. Была высказана гипотеза, что Байкальский субтип возник в результате древней рекомбинации между вариантами, относящимися к сибирскому и дальневосточному подтипам. Доказательству правомерности этого предположения и  посвящена данная статья.

В ходе исследования было получено подтверждение различий в филогенетических историях между разными геномными регионами ВКЭ Байкальского субтипа, что указывает на его рекомбинационное происхождение. Это утверждение основано на двух типах филогенетических свидетельств, осуществленных с надежной статистической поддержкой. Осуществленное исследование завершает долгие дебаты о возможной роли рекомбинации в эволюции вируса клещевого энцефлита. Роль рекомбинационных событий в происхождении других вариантов вируса клещевого энцефалита остается предметом будущих исследований.

Поздравляем авторов с публикацией и желаем дальнейших научных успехов!

Прочитать статью

Пресс-служба НЦ ПЗСРЧ


Возврат к списку