В международном высокорейтинговом научном журнале «Viruses» (Q1) опубликованы результаты исследования, посвященного генетическому разнообразию вируса клещевого энцефалита (ВКЭ) на территории Кыргызской Республики.
Работа выполнена коллективом исследователей из России при участии специалистов Научного центра проблем здоровья семьи и репродукции человека. В основу исследования легли штаммы вируса клещевого энцефалита из коллекции микроорганизмов НЦ ПЗСРЧ, представляющей собой уникальный биологический ресурс для изучения природно-очаговых инфекций.
В ходе исследования были полностью секвенированы геномы семи штаммов вируса, выделенных из клещей Ixodes persulcatus, собранных на территории Кыргызстана. Анализ проводился с использованием современных технологий высокопроизводительного секвенирования нового поколения (NGS), что позволило получить полные геномные последовательности вирусов и провести их детальное филогенетическое исследование.
Сравнение новых данных с ранее опубликованными геномами показало, что на территории Кыргызстана преимущественно циркулирует сибирский подтип вируса клещевого энцефалита, представленный сразу тремя генетическими линиями - Vasilchenko, Zausaev и Bosnia. Кроме того, впервые подтверждено присутствие дальневосточного подтипа вируса в данном регионе.
Полученные результаты существенно расширяют современные представления о молекулярной эпидемиологии вируса клещевого энцефалита в Центральной Азии. Исследование свидетельствует о высокой генетической неоднородности популяции вируса и позволяет предположить, что территория Кыргызстана является одной из наиболее южных границ распространения как сибирского, так и дальневосточного подтипов вируса клещевого энцефалита.
Научная ценность работы определяется не только получением новых полногеномных последовательностей, внесенных в международную базу данных GenBank, но и использованием уникальных архивных штаммов, сохраняемых в коллекции НЦ ПЗСРЧ. Биологические коллекции подобного уровня являются важнейшей основой для фундаментальных исследований, мониторинга эволюции возбудителей природно-очаговых инфекций и совершенствования эпидемиологического надзора.
Полученные данные имеют большое значение для дальнейшего изучения распространения вируса клещевого энцефалита, оценки эпидемиологических рисков и разработки научно обоснованных подходов к профилактике заболевания в странах Центральной Азии.
Статья находится в открытом доступе: Shigapova, L.H.; Kozlova, I.V.;Klink, G.V.; Doroshchenko, E.K.; Suntsova, O.V.; Lisak, O.V.; Shagimardanova, E.I.; Dzhioev, Y.P.; Zlobin, V.I.; Tkachev, S.E. GeneticDiversityofTick-BorneEncephalitisVirusinKyrgyzstan. Viruses 2026, 18, 107. https://doi.org/10.3390/v18010107
