664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

EN RU

Лаборатория молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики

Руководитель лаборатории
доктор медицинских наук Козлова Ирина Валерьевна

Козлова.jpg

Лаборатория молекулярной эпидемиологии вирусов создана в 1989 г. В 2010 г. произошло ее объединение с лабораторией генетической диагностики в одну единую лабораторию — молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики. В лаборатории проводятся фундаментальные и прикладные исследования по изучению генетической изменчивости и эволюции вируса клещевого энцефалита в природных очагах Евразии. А также проводятся работы в области молекулярной эпидемиологии других возбудителей, передаваемых через укус клеща (боррелии, эрлихии, неоэрлихии, анаплазмы, риккетсии, бабезии, B. miyamotoi). Изучается влияние генетической вариабельности возбудителей на эффективность диагностики и профилактики клещевых инфекций.

Перспективными направлениями исследований сотрудников лаборатории являются:

  • Изучение генетической вариабельности, фенотипической изменчивости, эволюции вируса клещевого энцефалита, циркулирующего на территории Евразии, изучение механизмов формирования уникальных штаммов с «мозаичным» геномом и их роли в формировании эволюционной стратегии вируса, изучение молекулярных основ патогенности ВКЭ, реконструкция его эволюционной истории;
  • Изучение видового и генетического разнообразия возбудителей бактериальной и протозойной природы, инфицирующих популяции иксодовых клещей на территории Восточной Сибири;
  • Поиск генетических факторов организма хозяина (человека), предопределяющих степень его восприимчивости/устойчивости к вирусу клещевого энцефалита;
  • Изучение противовирусной активности новых лекарственных соединений.

Поддержка исследований (гранты, конкурсы)

  • Грант РНФ «Сравнительный геномный и биоинформационный анализ штаммов европейского генотипа вируса клещевого энцефалита, циркулирующего в экосистемах Сибири и Западной Европы», № заявки14-15-00615 (2014-2016 гг.);
  • Проект «Разработка комплекса программного обеспечения для моделирования физико-химических и биологических свойств антигенных эпитопов белков разных генотипов вируса клещевого энцефалита» по Программе фундаментальных исследований по стратегическим направлениям развития науки Президиума РАН № 1 «Фундаментальные проблемы математического моделирования» (2014-2017 гг.);
  • Грант РФФИ мол_а № 14-04-32375 «Изучение генетического разнообразия гемопаразитов рода Babesia на территории Сибири на основе маркерного гена 18S рРНК» (2014-2015 гг.);
  • Изучение противовирусной активности новых лекарственных соединений.

Наши разработки и объекты интеллектуальной собственности

В международную электронную базу данных GenBank при участии сотрудников лаборатории депонировано более 200 нуклеотидных последовательностей штаммов вируса клещевого энцефалита, Ananplasma phagocytophilum, Candidatus Neoehrlichia mikurensis, бабезий, тейлерий. В Государственную коллекцию вирусов при институте вирусологии имени Д.И. Ивановского депонировано 133 штамма вируса клещевого энцефалита.

Опубликовано 10 монографий (в том числе 2 зарубежные), более 300 печатных работ. Созданы 3 базы данных:

  • «Генетические свойства штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на территории Восточной Сибири». Свидетельство о государственной регистрации № 201162620063 от 11 января 2011 г.
  • «Биологические свойства штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на территории Восточной Сибири». Свидетельство о государственной регистрации № 2010620667 от 3 ноября 2010 г.
  • «Генетические и фенотипические свойства штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на территории Евразии» Свидетельство о государственной регистрации № 2017620500 от 03.05.2017 г.

Сотрудничество с российскими и зарубежными организациями

  • Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск;
  • Institute of Parasitology, Biology Centre of the Czech Academy of Sciences, České BuděJovice;
  • Иркутский государственный медицинский университет;
  • ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», г. Новосибирск;
  • ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора;
  • ФГБУН Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук;
  • Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Иркутская государственная сельскохозяйственная академия»;
  • Федеральное бюджетное учреждение здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в Иркутской области»;
  • Служба ветеринарии Иркутской области.

Докторские диссертации:

  • Научное обоснование и пути совершенствования экстренной диагностики и профилактики трансмиссивных клещевых инфекций в условиях сочетанности природных очагов, дисс. докт. мед. наук, 14.00.30 — эпидемиология (Козлова И.В., 2008);
  • Вопросы генотипирования и анализ генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита, дисс. докт. биол. наук, 03.02.02 — вирусология (Демина Т.В., 2012);
  • Молекулярная эпидемиология и экология вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири, 03.02.02 — вирусология (Верхозина М.М., 2014).

Кандидатские диссертации:

  • Молекулярно-эпидемиологический и филогенетический анализ генетической гетерогенности популяций вируса клещевого энцефалита на азиатской территории России, дисс. канд. биол. наук: специальности: 14.00.30 — эпидемиология, 03.00.06 — вирусология (Джиоев Ю.П., 2003);
  • Эколого-паразитологическая характеристика клещевого боррелиоза в Прибайкалье, канд. дис. биол. наук: 03.00.16 — экология (Сунцова О.В.);
  • Распространение и генетическая вариабельность бактерий семейства Anaplasmataceae в сочетанных природных очагах клещевых инфекций Иркутской области дис. канд. биол. наук: 03.02.03 — микробиология (Дорощенко Е.К., 2013).

Выполняемые кандидатские диссертации

  • «Комплексная биоценотическая характеристика уникального сочетанного очага трансмиссивных клещевых инфекций на территории Иркутской области» на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.08 — «экология» (Лисак О.В.);
  • «Комплексная характеристика вируса клещевого энцефалита европейского субтипа, циркулирующего на территории Сибири» на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.02 — «вирусология».

Повышение квалификации

  • Сертификат о прохождении обучения на базе Научно-производственной лаборатории по разработке и производству препаратов для диагностики инфекционных заболеваний человека и животных Отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора по теме «Диагностика инфекционных заболеваний методом полимеразной цепной реакции» (72 часа), выдан Сунцовой Ольге Владимировне 23 января 2015 г.;
  • Сертификат о прохождении обучения на базе Научно-производственной лаборатории по разработке и производству препаратов для диагностики инфекционных заболеваний человека и животных Отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора по теме «Диагностика инфекционных заболеваний методом полимеразной цепной реакции» (72 часа), выдан Лисак Оксане Васильевне 23 января 2015 г.;
  • Сертификат о прохождении обучения на базе Научно-производственной лаборатории по разработке и производству препаратов для диагностики инфекционных заболеваний человека и животных Отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора по теме «Диагностика инфекционных заболеваний методом полимеразной цепной реакции» (72 часа), выдан Дорощенко Елене Константиновне 23 января 2015 г.;
  • Удостоверение о повышении квалификации № 382490568492 регистрационный номер 1951 по программе ОУ «Эпидемиология» в объеме 288 часа (с 24 марта 2014 г. по 17 мая 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Козловой И.В.;
  • Удостоверение о повышении квалификации № 382490568496 регистрационный номер 1955 по программе ОУ «Эпидемиология» в объеме 288 часа (с 24 марта 2014 г. по 17 мая 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Лисак О.В.;
  • Удостоверение о повышении квалификации № 382401800120 регистрационный номер 5364 по программе ОУ «Бактериология» в объеме 216 часов (с 27 октября 2014 г. по 6 декабря 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Лисак О.В.;
  • Удостоверение о повышении квалификации № 382490568488 регистрационный номер 1947 по программе ОУ «Эпидемиология» в объеме 288 часа (с 24 марта 2014 г. по 17 мая 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Дорощенко Е.К.;
  • Удостоверение о повышении квалификации № 382401800126 регистрационный номер 5370 по программе ОУ «Бактериология» в объеме 216 часов (с 27 октября 2014 г. по 6 декабря 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Сунцовой О.В.;
  • Удостоверение о повышении квалификации № 382490568413 регистрационный номер 1964 по программе ОУ «Эпидемиология» в объеме 288 часа (с 24 марта 2014 г. по 17 мая 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Сунцовой О.В.;
  • Сертификат по специальности «Эпидемиология» № 0338240116728 регистрационный номер 3722, дата выдачи 17 мая 2014 г. сроком на 5 лет (Козлова И..В.);
  • Удостоверение о повышении квалификации № 180000544629 регистрационный номер 5749 по программе ОУ «Бактериология» в объеме 216 час. (с 2 ноября по 14 декабря 2015 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Козловой И.В.;
  • Сертификат специалиста по специальности «Бактериология» А № 0338180381023, дата выдачи 14 декабря 2015 г. сроком на 5 лет (до 14 декабря 2015 г.) (Козлова И.В.);
  • Стажировка Парамонова А.И. на рабочем месте в Veterinary Research Institute (Брно, Чешская Республика), Institute of Parasitology, Biology Centre, Czech Academy of Sciences (Ceske Budejovice) с 1.12. 2014 по 17.12.2014 г.;
  • Стажировка Савиновой Ю.С. на рабочем месте в Veterinary Research Institute (Брно, Чешская Республика) с 31.10. по 17.11.2016 г.;

В настоящее время в лаборатории работают:

  • Дорощенко Елена Константиновна — н.с., к.б.н.;
  • Сунцова Ольга Владимировна — н.с., к.б.н.;
  • Лисак Оксана Васильевна — м.н.с.;
  • Савинова Юлия Сергеевна — м.н.с.;
  • Черноиванова Ольга Олеговна — м.н.с.;
  • Парамонов Алексей Игоревич — лаборант-исследователь.
Лаборатория молекулярной эпидемиологии - коллектив.jpg