RU \ ENG
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение
версия для слабовидящих


Лаборатория молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики

Руководитель лаборатории
доктор медицинских наук Козлова Ирина Валерьевна

Козлова.jpg

Лаборатория молекулярной эпидемиологии вирусов создана в 1989 г. В 2010 г. произошло ее объединение с лабораторией генетической диагностики в одну единую лабораторию — молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики. В лаборатории проводятся фундаментальные и прикладные исследования по изучению генетической изменчивости и эволюции вируса клещевого энцефалита в природных очагах Евразии. А также проводятся работы в области молекулярной эпидемиологии других возбудителей, передаваемых через укус клеща (боррелии, эрлихии, неоэрлихии, анаплазмы, риккетсии, бабезии, B. miyamotoi). Изучается влияние генетической вариабельности возбудителей на эффективность диагностики и профилактики клещевых инфекций.

Перспективными направлениями исследований сотрудников лаборатории являются:

  • Изучение генетической вариабельности, фенотипической изменчивости, эволюции вируса клещевого энцефалита, циркулирующего на территории Евразии, изучение механизмов формирования уникальных штаммов с «мозаичным» геномом и их роли в формировании эволюционной стратегии вируса, изучение молекулярных основ патогенности ВКЭ, реконструкция его эволюционной истории;
  • Изучение видового и генетического разнообразия возбудителей бактериальной и протозойной природы, инфицирующих популяции иксодовых клещей на территории Восточной Сибири;
  • Поиск генетических факторов организма хозяина (человека), предопределяющих степень его восприимчивости/устойчивости к вирусу клещевого энцефалита;
  • Изучение противовирусной активности новых лекарственных соединений.

Поддержка исследований (гранты, конкурсы)

  • Грант РНФ «Сравнительный геномный и биоинформационный анализ штаммов европейского генотипа вируса клещевого энцефалита, циркулирующего в экосистемах Сибири и Западной Европы», № заявки14-15-00615 (2014-2016 гг.);
  • Проект «Разработка комплекса программного обеспечения для моделирования физико-химических и биологических свойств антигенных эпитопов белков разных генотипов вируса клещевого энцефалита» по Программе фундаментальных исследований по стратегическим направлениям развития науки Президиума РАН № 1 «Фундаментальные проблемы математического моделирования» (2014-2017 гг.);
  • Грант РФФИ мол_а № 14-04-32375 «Изучение генетического разнообразия гемопаразитов рода Babesia на территории Сибири на основе маркерного гена 18S рРНК» (2014-2015 гг.);
  • Изучение противовирусной активности новых лекарственных соединений.

Наши разработки и объекты интеллектуальной собственности

В международную электронную базу данных GenBank при участии сотрудников лаборатории депонировано более 200 нуклеотидных последовательностей штаммов вируса клещевого энцефалита, Ananplasma phagocytophilum, Candidatus Neoehrlichia mikurensis, бабезий, тейлерий. В Государственную коллекцию вирусов при институте вирусологии имени Д.И. Ивановского депонировано 133 штамма вируса клещевого энцефалита.

Опубликовано 10 монографий (в том числе 2 зарубежные), более 300 печатных работ. Созданы 3 базы данных:

  1. «Генетические свойства штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на территории Восточной Сибири». Свидетельство о государственной регистрации № 201162620063 от 11 января 2011 г.
  2. «Биологические свойства штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на территории Восточной Сибири». Свидетельство о государственной регистрации № 2010620667 от 3 ноября 2010 г.
  3. «Генетические и фенотипические свойства штаммов вируса клещевого энцефалита, изолированных на территории Евразии» Свидетельство о государственной регистрации № 2017620500 от 03.05.2017 г.

Сотрудничество с российскими и зарубежными организациями

  1. Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, г. Новосибирск;
  2. Institute of Parasitology, Biology Centre of the Czech Academy of Sciences, České BuděJovice;
  3. Иркутский государственный медицинский университет;
  4. ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук», г. Новосибирск;
  5. ФБУН Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора;
  6. ФГБУН Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук;
  7. Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Иркутская государственная сельскохозяйственная академия»;
  8. Федеральное бюджетное учреждение здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в Иркутской области»;
  9. Служба ветеринарии Иркутской области.

Докторские диссертации:

  1. Научное обоснование и пути совершенствования экстренной диагностики и профилактики трансмиссивных клещевых инфекций в условиях сочетанности природных очагов, дисс. докт. мед. наук, 14.00.30 — эпидемиология (Козлова И.В., 2008);
  2. Вопросы генотипирования и анализ генетической вариабельности вируса клещевого энцефалита, дисс. докт. биол. наук, 03.02.02 — вирусология (Демина Т.В., 2012);
  3. Молекулярная эпидемиология и экология вируса клещевого энцефалита в Восточной Сибири, 03.02.02 — вирусология (Верхозина М.М., 2014).

Кандидатские диссертации:

  1. Молекулярно-эпидемиологический и филогенетический анализ генетической гетерогенности популяций вируса клещевого энцефалита на азиатской территории России, дисс. канд. биол. наук: специальности: 14.00.30 — эпидемиология, 03.00.06 — вирусология (Джиоев Ю.П., 2003);
  2. Эколого-паразитологическая характеристика клещевого боррелиоза в Прибайкалье, канд. дис. биол. наук: 03.00.16 — экология (Сунцова О.В.);
  3. Распространение и генетическая вариабельность бактерий семейства Anaplasmataceae в сочетанных природных очагах клещевых инфекций Иркутской области дис. канд. биол. наук: 03.02.03 — микробиология (Дорощенко Е.К., 2013).

Выполняемые кандидатские диссертации

  1. «Комплексная биоценотическая характеристика уникального сочетанного очага трансмиссивных клещевых инфекций на территории Иркутской области» на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.08 — «экология» (Лисак О.В.);
  2. «Комплексная характеристика вируса клещевого энцефалита европейского субтипа, циркулирующего на территории Сибири» на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 03.02.02 — «вирусология».

Повышение квалификации

  1. Сертификат о прохождении обучения на базе Научно-производственной лаборатории по разработке и производству препаратов для диагностики инфекционных заболеваний человека и животных Отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора по теме «Диагностика инфекционных заболеваний методом полимеразной цепной реакции» (72 часа), выдан Сунцовой Ольге Владимировне 23 января 2015 г.;
  2. Сертификат о прохождении обучения на базе Научно-производственной лаборатории по разработке и производству препаратов для диагностики инфекционных заболеваний человека и животных Отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора по теме «Диагностика инфекционных заболеваний методом полимеразной цепной реакции» (72 часа), выдан Лисак Оксане Васильевне 23 января 2015 г.;
  3. Сертификат о прохождении обучения на базе Научно-производственной лаборатории по разработке и производству препаратов для диагностики инфекционных заболеваний человека и животных Отдела молекулярной диагностики и эпидемиологии ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора по теме «Диагностика инфекционных заболеваний методом полимеразной цепной реакции» (72 часа), выдан Дорощенко Елене Константиновне 23 января 2015 г.;
  4. Удостоверение о повышении квалификации № 382490568492 регистрационный номер 1951 по программе ОУ «Эпидемиология» в объеме 288 часа (с 24 марта 2014 г. по 17 мая 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Козловой И.В.;
  5. Удостоверение о повышении квалификации № 382490568496 регистрационный номер 1955 по программе ОУ «Эпидемиология» в объеме 288 часа (с 24 марта 2014 г. по 17 мая 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Лисак О.В.;
  6. Удостоверение о повышении квалификации № 382401800120 регистрационный номер 5364 по программе ОУ «Бактериология» в объеме 216 часов (с 27 октября 2014 г. по 6 декабря 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Лисак О.В.;
  7. Удостоверение о повышении квалификации № 382490568488 регистрационный номер 1947 по программе ОУ «Эпидемиология» в объеме 288 часа (с 24 марта 2014 г. по 17 мая 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Дорощенко Е.К.;
  8. Удостоверение о повышении квалификации № 382401800126 регистрационный номер 5370 по программе ОУ «Бактериология» в объеме 216 часов (с 27 октября 2014 г. по 6 декабря 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Сунцовой О.В.;
  9. Удостоверение о повышении квалификации № 382490568413 регистрационный номер 1964 по программе ОУ «Эпидемиология» в объеме 288 часа (с 24 марта 2014 г. по 17 мая 2014 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Сунцовой О.В.;
  10. Сертификат по специальности «Эпидемиология» № 0338240116728 регистрационный номер 3722, дата выдачи 17 мая 2014 г. сроком на 5 лет (Козлова И..В.);
  11. Удостоверение о повышении квалификации № 180000544629 регистрационный номер 5749 по программе ОУ «Бактериология» в объеме 216 час. (с 2 ноября по 14 декабря 2015 г.) на базе ГБОУ ДПО ИГМАПО Минздрава России Козловой И.В.;
  12. Сертификат специалиста по специальности «Бактериология» А № 0338180381023, дата выдачи 14 декабря 2015 г. сроком на 5 лет (до 14 декабря 2015 г.) (Козлова И.В.);
  13. Стажировка Парамонова А.И. на рабочем месте в Veterinary Research Institute (Брно, Чешская Республика), Institute of Parasitology, Biology Centre, Czech Academy of Sciences (Ceske Budejovice) с 1.12. 2014 по 17.12.2014 г.;
  14. Стажировка Савиновой Ю.С. на рабочем месте в Veterinary Research Institute (Брно, Чешская Республика) с 31.10. по 17.11.2016 г.;

В настоящее время в лаборатории работают:

  1. Дорощенко Елена Константиновна — н.с., к.б.н.;
  2. Сунцова Ольга Владимировна — н.с., к.б.н.;
  3. Лисак Оксана Васильевна — м.н.с.;
  4. Савинова Юлия Сергеевна — м.н.с.;
  5. Черноиванова Ольга Олеговна — м.н.с.;
  6. Парамонов Алексей Игоревич — лаборант-исследователь.

Лаборатория молекулярной эпидемиологии - коллектив.jpg